有的农户用病猪住过的猪圈再养猪，结果猪再次发病，甚至死亡，这往往与前一批猪存在病毒有关。为此，必须将圈舍消毒后再养猪。已使用过的猪圈、猪舍消毒方法如下：
先将圈舍清扫干净，再用20%的石灰乳或3%的热烧碱水、20%的漂白粉进行消毒。
消毒的次序为墙壁、圈栏、门窗、食槽、地面、用具及门口地面。消毒药水可用扫帚涂刷，最好用喷雾器喷酒。
消毒完毕，猪圈设有门窗的应关闭2小时~3小时再打开，同时将食槽及地面用清水冲洗干净。
2、猪圈土壤消毒要求泥土地面应先清除粪便、垫草等污物，然后再将上面的一层泥土铲除，最后用20%的漂白粉或20%的石灰乳、3%热烧碱水浇酒。
3、粪便及污水的消毒处理少量的粪便、垫草等可以深埋。粪便的数量如果较多，可用发酵法来消毒。方法是：
在离猪舍稍远的地方挖一浅沟，深约40公分，宽约2米，长度视粪便多少而定。底部先铺健康猪粪一层，然后将病猪粪堆上，在病猪粪上边再盖一层健康猪粪及杂草，最后用稀泥密封。
病猪粪很稀时，可添加干土或干碎草，太干时可加入适量水，使其迅速发酵。夏秋约1个月，冬春约2个月，即可达到消毒的目的。
病猪舍的污水，数量较少时可浇在粪便内一起发酵消毒。数量很多时可在污水总量中加入2%的生石灰粉或0.2%的漂白粉进行消毒。
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