蛋壳品质是蛋鸡饲养者关注的焦点，严重影响养殖效益。蛋壳颜色和质量的变化，既反应了鸡群的健康状况，同时也反映了所吃饲料的营养水平。据统计因蛋壳质量差造成的鸡蛋损失约为8%左右;蛋壳质量问题虽然不影响鸡蛋的营养价值，但能影响到消费者的消费心理，直接影响鸡蛋的销售和价格。蛋壳品质是衡量蛋鸡生产性能好与坏的重要指标之一。随着集约化的发展，提高蛋壳品质对蛋鸡业的发展具有举足轻重的作用。引起蛋壳变差的原因有疾病、饲料、鸡群日龄大小、应激因素等，现总结如下：
1、感染滑液囊支原体(MS)后造成的蛋壳质量变差
该病既有垂直传播也有水平传播，具有双重性，在种鸡上滑液囊支原体净化的难度很大。该病最近这两年在蛋鸡的发生率至高不下，而且鸡群在开产后依然有发病现像，产蛋迟迟难以上高峰。据报道MS的阳性率高达69%。蛋鸡MS感染后直接或间接影响鸡群的产蛋量和蛋壳品质下降，表现为鸡蛋的尖端部位有环状的粗糙(糙头蛋)、阴阳蛋。 由于蛋壳质量差，产出的鸡蛋在滚动过程破损严重，容易形成龙眼蛋，也有的蛋壳普遍较薄、鸡蛋形成裂纹严重。
2、传支影响蛋壳质量
主要表现开产时的软蛋和薄壳蛋，该病秋冬季节多发，鸡群在小鸡和青年鸡发病最多严重影响鸡群产蛋率和蛋品质量，雏鸡最怕冷应激，个别育雏场在寒冷的季节育雏时鸡舍供暖出现问题，表现为预热不充分、鸡舍温度偏低或脱温过早，是形成该病的原因之一，这种问题造成雏鸡的体质较差，免疫应答下降，免疫疫苗后产生的抗体水平低下，鸡群呼吸道疫病频发。
该病混合有滑液囊支原体是会严重抑制传支抗体的产生，从而造成鸡输卵管的异常发育(有的仅表现为输卵管异常发育而输卵管长度基本正常)，进而影响蛋壳的质量。
3、日龄因素
新开产蛋鸡所产蛋的蛋重小，蛋壳质量较好，随着蛋鸡周龄增长，肝脏功能和生理性生殖机能减退、生殖器管衰老、肠道吸收功能变差，都是最终影响蛋重的增加量。随着鸡群日龄的不断变大，鸡群蛋壳厚度和强度降低，破损率增高，尤其是50周龄后，水纹蛋、薄壳蛋、蛋壳钙化不良和其他可见缺陷蛋数量比例增大。尤其是霉菌毒素长期侵害，胆汁分泌不足，脂溶性维生素乳化吸收受影响，加之肠道吸收能力减低，会导致钙、磷、微量元素以及脂溶性维生素A、D、E吸收。
后期蛋大，钙的需要增加，蛋壳占蛋的比重变小，而且随着蛋鸡年龄的增加与生殖器官的不断衰老，雌激素分泌减少，促进维生素D3的免受酶降解的功能作用衰弱，产蛋造成营养的透支，体内的钙与磷加快消耗，蛋壳则相应较薄; 老鸡肠道吸收功能减弱，而且往往会有过料、拉稀等现象，吸收功能变差，建议在饲料中添加生物活性素、植物酵素等，修复肠道，消炎止泻，可以很好地改善肠道不好引起的鸡蛋品质不好的问题。
4、应激因素
鸡舍温度变化过大、转群应激、疫苗接种、鸡舍湿度过大等，都会引起生殖系统神经机能紊乱，肠道菌群失调，影响蛋壳钙化过程和色素沉积，会导致蛋壳颜色变浅，沙皮蛋、软壳蛋，甚至畸形蛋的出现。
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